مرور کلی

EGFR شایع ترین عامل قابل عمل در سرطان ریه سلول های غیر کوچک است، اما یک آزمایش به ندرت داستان کامل را می گوید.پانل تشخیص EGFR 5 سایت DdPCR پنج سایت مهم بالینی را بازجویی می کند، T790M، L858R، L861Q و حذف اگزون 19 با استفاده از PCR قطره ای دیجیتال، یک تکنیک ساخته شده برای پیدا کردن جهش های بسیار کم افزایشی که توالی معمولی می تواند از دست بدهد.این مقاله زیست شناسی هر یک از این سایت ها را توضیح می دهد، چرا T790M پس از درمان TKI خط اول اهمیت دارد و چگونه حساسیت PCR دیجیتال نظارت بر مقاومت را تغییر می دهد.

جهش های فعال سازی اولیه: L858R و حذف اکسون 19

L858R در اگزون 21 و حذف اگزون 19 دو جهش فعال کننده EGFR شایع هستند که بیشتر بیماری های حساس به TKI را تشکیل می دهند.DdPCR برای بیماران که در حال شروع درمان خط اول هستند، تأیید سریع می دهد.تشخیص در دی ان ای تومور در جریان نیز اجازه می دهد تا پاسخ به درمان را ردیابی کنید: کاهش کسری آلل جهش یافته نشان دهنده کنترل بیماری است.در حالی که یکی از افزایش ممکن است از پیشرفت قبل از تصویربرداری هشدار دهد.

مقاومت TKI خط اول T790M

T790M مکانیسم مقاومتی کلاسیک به EGFR TKI های نسل اول و دوم است. این جهش ثانویه در زیر مجموعه ای از تومورها پس از پاسخ اولیه ظاهر می شود.و حضورش باعث تغییر در مدیریت می شه: مهار کننده های نسل سوم مرحله بعدی استاندارد هستند چون بر روی کلون های حامل T790M عمل می کنند.چالش این است که کلون اغلب در یک کسری کم در داخل DNA تومور در حال گردش در زمان پیشرفت وجود داردPCR دیجیتال DNA را به هزاران قطره تقسیم می کند و حوادث مثبت را می شمارد و کپی هایی را که در زیر رزولوشن روش های روتین هستند تشخیص می دهد.

چرا G719S و L861Q لیاقت دارند که از خود استفاده کنند؟

G719S (اکسون 18) و L861Q (اکسون 21) گونه های کمتر رایج EGFR هستند، اما از نظر بیولوژیکی بی اهمیت نیستند.و برخی از راهنمایی ها آنها را به دسته های مرتبط با درمان گروه بندی می کنند.شامل کردن آنها در یک پانل پنج مکان، انواع نادر را نشان می دهد که در غیر این صورت ممکن است از دست داده شوند اگر فقط نقاط گرم کلاسیک آزمایش شوند، گسترش کاربرد بالینی بدون گسترش به مقیاس ژن کامل.

حساسیت بالا برای مقاومت کم افزایشی

قوی ترین استدلال برای DdPCR در نظارت بر مقاومت حساسیت تحلیلی است. یک برداشت خون تحت سلطه DNA نوع وحشی از سلول های طبیعی است.و یک کلون مقاومتی ممکن است تنها بخش کوچکی از کل. پی سی آر قطره ای دیجیتال این پس زمینه را بسیار بهتر از روش های انبوه تحمل می کند زیرا هر قطره یک واکنش مستقل است ، بنابراین حوادث جهش یافته نادر به جای میانگین محاسبه می شوند.پاداش اين است که مقاومت در حال ظهور زودتر تشخیص داده شود..

سوالات عمومی

س: چرا T790M مهم ترین سایت در این پانل است؟A: T790M رایج ترین مکانیسم مقاومت به EGFR TKI های نسل اول و دوم است.تشخیص آن در مقدار کم از انتقال به یک مهار کننده نسل سوم فعال در برابر تومورهای حامل T790M پشتیبانی می کند..

س: DdPCR چگونه جهش هایی را تشخیص می دهد که توالی ممکن است از بین برود؟پاسخ: دی پی سی آر نمونه را به هزاران قطره تقسیم می کند و واکنش های مثبت را به صورت جداگانه شمارش می کند، و کسری های جهش یافته پایین را در پس زمینه خون نوع وحشی دفن می کند.

سوال: آیا G719S و L861Q با L858R و 19del یکسان هستند؟ج: نه. انواع غیر معمول هنوز به برخی از TKIs پاسخ می دهند اما در دستورالعمل ها به طور جداگانه گروه بندی شده اند، بنابراین از جمله آنها جلوگیری از از دست دادن رانندگان نادر قابل درمان می شود.

س: این پانل DdPCR EGFR از چه نوع نمونه ای استفاده می کند؟A: معمولاً برای نظارت غیر تهاجمی بر ctDNA پلاسما استفاده می شود، اگرچه DNA بافت نیز می تواند مورد بازجویی قرار گیرد. انواع نمونه های معتبر را با آزمایشگاه خود تأیید کنید.